生物信息学

1 (p0-1): A 生物信息学概述
1 (p0-2): A1 生物信息学的范围
4 (p0-3): A2 生物信息学与互联网
8 (p0-4): A3 有用的生物信息学WWW网站
10 (p0-5): B 数据采集
10 (p0-6): B1 DNA、RNA和蛋白质测序
17 (p0-7): B2 蛋白质结构的确定
19 (p0-8): B3 基因和蛋白质表达数据
24 (p0-9): B4 蛋白质互作数据
30 (p0-10): C 数据库——内容、结构和注释
30 (p0-11): C1 文件格式
36 (p0-12): C2 已注释的序列数据库
42 (p0-13): C3 基因组和特定物种的数据库
47 (p0-14): C4 其他数据库
52 (p0-15): D 生物数据检索
52 (p0-16): D1 通过Entrez和DBGET/LINKDB的数据检索
57 (p0-17): D2 使用SRS（序列检索系统）的数据检索
61 (p0-18): E1 序列相似性搜索
61 (p0-19): E 通过序列相似性标准搜索序列数据库
66 (p0-20): E2 氨基酸替代矩阵
72 (p0-21): E3 数据库搜索：FASTA和BLAST
82 (p0-22): E4 序列过滤程序
84 (p0-23): E5 数据库的迭代搜索和PSI-BLAST
88 (p0-24): F 多序列联配：基因和蛋白质家族
88 (p0-25): F1 多序列联配和家族关系
92 (p0-26): F2 蛋白质家族和模式数据库
97 (p0-27): F3 蛋白质结构域家族
102 (p0-28): G 系统发育学
102 (p0-29): G1 系统发育学、遗传分类学和存在论
108 (p0-30): G2 构建系统发育树
114 (p0-31): G3 大分子序列进化
118 (p0-32): H 序列注释
118 (p0-33): H1 基因组注释原理
124 (p0-34): H2 注释工具和资源
128 (p0-35): I1 蛋白质结构的概念模型
128 (p0-36): I 结构信息学
135 (p0-37): I2 蛋白质三维结构与蛋白质功能的关系
137 (p0-38): I3 蛋白质结构和功能的进化
143 (p0-39): I4 获取、观察和分析结构数据
150 (p0-40): I5 结构联配
154 (p0-41): I6 已知三维结构的蛋白质分类：CATH与SCOP
158 (p0-42): I7 蛋白质结构预测简介
161 (p0-43): I8 通过比较建模预测结构
166 (p0-44): I9 二级结构预测
172 (p0-45): I10 高级蛋白质结构预测与预测策略
176 (p0-46): J 微阵列数据分析
176 (p0-47): J1 微阵列数据：分析方法
182 (p0-48): J2 微阵列数据：工具和资源
188 (p0-49): J3 序列采样和SAGE
192 (p0-50): K 蛋白质组数据分析
192 (p0-51): K1 双向凝胶电泳数据分析
199 (p0-52): K2 蛋白质质谱数据分析
204 (p0-53): L1 分子途径的建模与重建
204 (p0-54): L 高阶模型
210 (p0-55): L2 蛋白质互作生物信息学
216 (p0-56): L3 高阶模型
220 (p0-57): M 生物学中的化学信息学
220 (p0-58): M1 分子表示的规范
227 (p0-59): M2 化学信息学资源
233 (p0-60): N 制药业中的生物信息学
233 (p0-61): N1 生物信息学和药物发现
238 (p0-62): N2 药物信息学资源
246 (p0-63): O 生物信息学计算的基本原理
246 (p0-64): O1 运行计算机软件
250 (p0-65): O2 计算机操作系统
253 (p0-66): O3 软件下载和安装
257 (p0-67): O4 数据库管理
260 (p0-68): 进一步阅读文献
264 (p0-69): 术语表 本书讲述了生物信息概述, 数据采集, 数据库--内容, 结构和注释, 生物数据检索, 通过序列相似性标准搜索序列数据库, 多阵列数据分析等内容